يعد قسم المختبرات الطبية ضمن البنية الأساسية الطبية التي تعتمد عليها كافة الأقسام الأخرى. و يعمل قسم المختبرات الطبية أيضا كمختبر احالة للعديد من المختبرات والمستشفيات المحلية الأخرى بالمنطقة. كما يوفر كافة الفحوصات المخبرية الروتينية للمرضى المنومين ومرضى العيادات الخارجية و مرضى الطوارئ ومرضى مرفق الرعاية التمريضية على مدار الساعة خلال اليوم. ويقدم هذا القسم الخدمات الطبية التالية:
- وحدة الأحياء المجهرية ( الميكروبيولوجية) التي ينصب تركيزها بشكل أساسي على عمليات الاستنبات، للبحث عن عوامل المرض المشتبه بها ، والتي عند العثور عليها يتم تحديدها بقدر أكبر من الدقة بناء على الاختبارات الكيميائية الحيوية. كذلك، يتم إجراء اختبار الحساسية لتحديد ما إذا كان العامل المرضي حساسا أو مقاوما لدواء بعينه أو لا. بعد ذلك يوضع تقرير يشمل النتائج مع تحديد الكائن الحي أو الكائنات الحية التي تم التعرف عليها ، بالإضافة إلى مقدار الدواء أو الأدوية التي ينبغي وصفها للمريض.
- وحدة الطفيليات، وهي الوحدة التي تتولى تشخيص الطفيليات التي قد تؤثر على جسم الإنسان.
- وحدة الفيروسات، تختص بالتعرف على الفيروسات ( أو العوامل الفيروسية أو الأجسام المضادة) في الدم والبول والسائل النخاعي.
- وحدة أمراض الدم ، تختص بفحوصات الدم الشاملة من أجل التوصل لإحصاءات كاملة لمكونات الدم وصور الدم والأنواع الشاذة من الهيموجلوبين، فضلا عن الكثير من الاختبارات المتخصصة الأخرى.
- وحدة تجلط الدم، تقوم بتحليل أزمنة تجلط الدم و مستوى عوامل التجلط.
- وحدة الكيمياء الحيوية الطبية التي تفحص المصل للتعرف على المواد الكيميائية الموجودة في الدم. وهذا يتضمن عددا من المواد كالدهون وسكر الدم والإنزيمات والهرمونات والالكتروليتات.
- وحدة السموم، تختص بشكل أساسي بإجراء اختبارات للعقاقير الدوائية والاستجمامية، ويتلقى هذا المختبر عينات البول والدم.
- ;وحدة المناعة والأمصال، والتي تستخدم مفهوم التفاعل بين مولد الضد والجسيمات المضادة كأداة لتشخيص أمراض المناعة. كما تعمل أيضا على تحديد ملائمة الأعضاء المزمع زراعتها .
- وحدة بنك الدم ، وتعني بتحديد فصائل الدم وإجراء اختبارات التوافق بين دم المتبرع والمستقبل. كما تجهز أيضا مكونات الدم ومشتقاته ومنتجات نقل الدم. وتحدد هذه الوحدة فصيلة دم المريض وحالة عامل الـ( Rh ) ، كما تفحص وجود الأجسام المضادة للمستضدات الشائعة الموجودة في خلايا الدم الحمراء ، وتربط بين الوحدات السلبية تجاه المستضدات.
- وحدة التشريح المرضي النسيجي، وتعالج الأنسجة الصلبة المأخوذة من الجسم ( الخزعات) لتقييمها على المستوى المجهري كما تشخص سبب المرض، سواء كان ورما أو التهابا أو غير ذلك.
- وحدة الباثولوجيا الخلوية، تقوم بفحص بقع الخلايا من كافة أنحاء الجسم ( مثلا من عنق الرحم) للتعرف على وجود التهابات أو سرطان أو غير ذلك من الحالات .